Quá trình điều tra cho thấy từ năm 2018-2024, có gần 3.200 Hợp đồng được ký giữa các tổ chức, cá nhân với Tạp chí Môi trường và Đô thị Việt Nam có tổng giá trị hơn là 80 tỉ đồng. Trong đó, có trên 450 trường hợp ký hợp đồng tài trợ chương trình "Cây chổi vàng", với các mức tiền từ 1 triệu đồng đến 300 triệu đồng.

Sau khi thu được tiền từ các hợp đồng hoặc thỏa thuận nêu trên, ngoài việc chi cho hoạt động của Chương trình Cây chối vàng, chia phần trăm 50-50 cho phóng viên, Đồng Xuân Thụ còn có dấu hiệu sử dụng vào việc đầu tư chứng khoán, bất động sản, sử dụng cá nhân khác.

Cơ quan công an cũng nhận thấy có dấu hiệu móc nối, liên kết, trao đổi thông tin giữa phóng viên Tạp chí với phóng viên của các báo khác để thực hiện hành vi chiếm đoạt tài sản, có dấu hiệu phạm nhiều tội như rửa tiền, tham ô tài sản, lừa đảo chiếm đoạt tài sản, cưỡng đoạt tài sản.